В  начале 14 века шло активное заселение территорий нынешнего района тюркскими народами, а именно башкирами и татарами, в результате чего в 1737 года образуется Исетская провинция, в состав которой вошли три уезда и 15 башкирских волостей.

В 1755 года образуется Оренбургская губерния, куда и вошла территория современного Сафакулевского района.

В 1782 году семейством Сафы Юмагулова было образовано село Сафакулево.  Продвигаясь вглубь Зауралья со своими стадами лошадей и крупнорогатым скотом, они нашли здесь прекрасные пастбища и много озер, богатые леса, дающие не только дрова и строительные материалы, а также множество ягод, грибов и дичи. Постепенно из несколько землянок поселение выросло большое село.

В 1895 году последовал новый раздел Оренбургской губернии, к ней отошел и Челябинский уезд. На территории района до революции находилось две волости: Карасевская и Сарт-Калмыкская.

 

 

Это территориальное деление сохранилось и в первые годы после революции (1917-1918 гг.). И только осенью 1919 г. территория района вошла в состав Башкирской автономной советской республики, центром которой являлся город Стерлитамак. В это время вместо волостей создаются кантоны, на этой территории образуется Яланский кантон с центром в селе Танрыкулово, просуществовавший до 1922 года.  В это время территория района переходит к Челябинскому уезду в составе вновь созданной Карасевской волости. И только в 1924 году проводится новое районирование всех территорий России, тогда здесь образуется Яланский район с центром в селе Мартыновка, который был подчинен Челябинскому округу Уральской области. В 1930 году Яланский район объединен с Катайским, и стал называться Ялано-Катайским районом, районным центром которого стало село Сафакулево. В 1934 году, со времени образования Челябинской области, район вывели из состава Уральской области и подчинили Челябинской. В 1940 году Ялано-Катайский район делят на два: Сафакулевский и Альменевский с подчинением Челябинску, и только в феврале 1943 года, со дня образования Курганской области, оба района вошли в ее состав.

В 1962 году район вновь ликвидируется и приписывается к  Щучанскому району. И только в 1965 году он выходит из состава Щучанского района и снова обретает самостоятельность.